MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017783	ATTG	2	8	549	556	25 %	50 %	25 %	0 %	386858679
2	NC_017783	TAT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
3	NC_017783	TGT	3	9	851	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
4	NC_017783	AAC	2	6	860	865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858679
5	NC_017783	CTA	2	6	868	873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858679
6	NC_017783	TAA	2	6	937	942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858679
7	NC_017783	TTA	2	6	1078	1083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858679
8	NC_017783	TGT	2	6	1090	1095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858679
9	NC_017783	ATC	2	6	1537	1542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858680
10	NC_017783	AAAAC	2	10	1589	1598	80 %	0 %	0 %	20 %	386858680
11	NC_017783	T	8	8	1613	1620	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
12	NC_017783	T	6	6	1687	1692	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
13	NC_017783	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
14	NC_017783	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858680
15	NC_017783	CAA	2	6	1767	1772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858680
16	NC_017783	AAT	2	6	1803	1808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858680
17	NC_017783	CCAT	2	8	1868	1875	25 %	25 %	0 %	50 %	386858680
18	NC_017783	T	6	6	1966	1971	0 %	100 %	0 %	0 %	386858680
19	NC_017783	ATTT	2	8	2050	2057	25 %	75 %	0 %	0 %	386858680
20	NC_017783	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858681
21	NC_017783	TA	3	6	2205	2210	50 %	50 %	0 %	0 %	386858681
22	NC_017783	TCTT	2	8	2212	2219	0 %	75 %	0 %	25 %	386858681
23	NC_017783	CAT	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858681
24	NC_017783	T	6	6	2293	2298	0 %	100 %	0 %	0 %	386858681
25	NC_017783	TAT	2	6	2330	2335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
26	NC_017783	A	7	7	2359	2365	100 %	0 %	0 %	0 %	386858681
27	NC_017783	A	6	6	2394	2399	100 %	0 %	0 %	0 %	386858681
28	NC_017783	TAA	2	6	2403	2408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
29	NC_017783	CTG	2	6	2435	2440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858681
30	NC_017783	TAA	2	6	2465	2470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
31	NC_017783	ATGT	2	8	2600	2607	25 %	50 %	25 %	0 %	386858681
32	NC_017783	AT	4	8	2694	2701	50 %	50 %	0 %	0 %	386858681
33	NC_017783	ATCA	2	8	2778	2785	50 %	25 %	0 %	25 %	386858681
34	NC_017783	ATA	2	6	2807	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858681
35	NC_017783	ACC	2	6	2850	2855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858681
36	NC_017783	TTA	2	6	2873	2878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858681
37	NC_017783	T	7	7	2885	2891	0 %	100 %	0 %	0 %	386858681
38	NC_017783	AATC	2	8	2906	2913	50 %	25 %	0 %	25 %	386858682
39	NC_017783	T	7	7	2927	2933	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
40	NC_017783	TTA	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
41	NC_017783	CTTT	2	8	3009	3016	0 %	75 %	0 %	25 %	386858682
42	NC_017783	T	7	7	3014	3020	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
43	NC_017783	A	6	6	3049	3054	100 %	0 %	0 %	0 %	386858682
44	NC_017783	TTA	2	6	3063	3068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
45	NC_017783	TA	3	6	3080	3085	50 %	50 %	0 %	0 %	386858682
46	NC_017783	T	6	6	3147	3152	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
47	NC_017783	CTT	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858682
48	NC_017783	AAT	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
49	NC_017783	A	6	6	3263	3268	100 %	0 %	0 %	0 %	386858682
50	NC_017783	TTA	2	6	3285	3290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
51	NC_017783	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858682
52	NC_017783	ATAA	2	8	3363	3370	75 %	25 %	0 %	0 %	386858682
53	NC_017783	TAA	2	6	3388	3393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858682
54	NC_017783	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858682
55	NC_017783	T	8	8	3428	3435	0 %	100 %	0 %	0 %	386858682
56	NC_017783	AC	3	6	3451	3456	50 %	0 %	0 %	50 %	386858682
57	NC_017783	CAA	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858683
58	NC_017783	T	6	6	3484	3489	0 %	100 %	0 %	0 %	386858683
59	NC_017783	CTC	2	6	3494	3499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
60	NC_017783	TAA	2	6	3543	3548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
61	NC_017783	ATT	2	6	3554	3559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858683
62	NC_017783	AAT	2	6	3598	3603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858683
63	NC_017783	TTC	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
64	NC_017783	AT	3	6	3670	3675	50 %	50 %	0 %	0 %	386858683
65	NC_017783	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858683
66	NC_017783	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
67	NC_017783	T	6	6	3710	3715	0 %	100 %	0 %	0 %	386858683
68	NC_017783	TATT	2	8	3768	3775	25 %	75 %	0 %	0 %	386858683
69	NC_017783	CT	3	6	3777	3782	0 %	50 %	0 %	50 %	386858683
70	NC_017783	CCT	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858683
71	NC_017783	TCTAT	2	10	3951	3960	20 %	60 %	0 %	20 %	386858683
72	NC_017783	TCT	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
73	NC_017783	TTC	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858683
74	NC_017783	TGT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858683
75	NC_017783	ATG	3	9	5713	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
76	NC_017783	TAA	2	6	5742	5747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
77	NC_017783	TAG	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858684
78	NC_017783	T	6	6	5881	5886	0 %	100 %	0 %	0 %	386858684
79	NC_017783	TAT	2	6	5894	5899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
80	NC_017783	GTT	3	9	5950	5958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858684
81	NC_017783	AG	3	6	5969	5974	50 %	0 %	50 %	0 %	386858684
82	NC_017783	TAT	2	6	5980	5985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
83	NC_017783	TAA	2	6	6006	6011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858684
84	NC_017783	ATT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858684
85	NC_017783	AT	4	8	8556	8563	50 %	50 %	0 %	0 %	386858685
86	NC_017783	AAACCA	2	12	8636	8647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858685
87	NC_017783	GTT	2	6	8651	8656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
88	NC_017783	GTT	2	6	8680	8685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858685
89	NC_017783	A	6	6	8690	8695	100 %	0 %	0 %	0 %	386858685
90	NC_017783	AAT	2	6	8726	8731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858685
91	NC_017783	TTAT	2	8	8788	8795	25 %	75 %	0 %	0 %	386858685
92	NC_017783	TAA	2	6	9523	9528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
93	NC_017783	ATA	2	6	9622	9627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858686
94	NC_017783	CAA	2	6	9652	9657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858686
95	NC_017783	AC	3	6	9674	9679	50 %	0 %	0 %	50 %	386858686
96	NC_017783	TTA	2	6	9693	9698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
97	NC_017783	TTA	2	6	9726	9731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
98	NC_017783	TAG	3	9	9737	9745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858686
99	NC_017783	TAT	2	6	9811	9816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
100	NC_017783	TTA	2	6	9868	9873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858686
101	NC_017783	AG	3	6	10007	10012	50 %	0 %	50 %	0 %	386858687
102	NC_017783	TAC	2	6	10054	10059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858687
103	NC_017783	AAT	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858687
104	NC_017783	AGAT	2	8	10272	10279	50 %	25 %	25 %	0 %	386858687
105	NC_017783	AGAT	2	8	10326	10333	50 %	25 %	25 %	0 %	386858687
106	NC_017783	AGAT	2	8	10359	10366	50 %	25 %	25 %	0 %	386858687
107	NC_017783	ATT	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687
108	NC_017783	TTA	2	6	10448	10453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.